配送料のからくり?

楽天で注文した商品が送り元「アマゾンジャパン合同会社」の荷物で届く。

支払う金額は最終的に変わらないからいいと言えばいいんだけど、なんとなく配送料のからくりとかがある気がする。
深読みし過ぎかな。。。